Амдерминская метеорологическая станция была организована в ноябре 1933 года и с 1 декабря того же года там начались регулярные метеорологические наблюдения. Почти век точных наблюдений.
История гидрометеорологических наблюдений и развитие гидрометеорологической службы в Амдерме тесно связано с историей освоения Заполярья, Северного морского пути и полярной авиации.
Первые годы на полярной станции Амдерма проводился комплекс метеорологических наблюдений. С 1935 года - комплекс морских прибрежных гидрометеорологических наблюдений. В дальнейшем в программу метеорологических наблюдений были включены наблюдения за температурой поверхности почвы и температурой почвы на глубинах, гололедно-изморозевыми отложениями, начаты наблюдения за продолжительностью солнечного сияния. Со временем небольшая гидрометеорологическая станция стала крупным арктическим управлением гидрометслужбы - Амдерминским УГМС, созданного в 1955 году. В период 1973-1978 годах на станции проводились геомагнитные наблюдения, а с 1948 по 1992 год - аэрологические зондирования атмосферы. С 1948 года на станции проводятся агрометеорологические наблюдения в районах северного оленеводства.
Амдерминским УГМС руководили известные полярники. С 1974 по 1979 года её возглавлял известный полярник Артур Николаевич Чилингаров.
В дни праздничных мероприятий Первый Вице-президент Всероссийской общественной организации Русское географическое общество приветствовал коллектив, ветераном и участником торжественных мероприятий приветственным адресом: «Отрадно, что за свою многолетнюю и славную историю коллективом внесён огромный вклад в изучение изменения климата, физико-химических процессов Земли, а также защиту окружающей среды от воздействия опасных природных явлений. С самого основания на станции работают высокопрофессиональные специалисты, преданные своей редкой и ответственной профессии. Желаю Морской гидрометеорологической станции - 2 Амдерма развития и процветания, а всем участникам мероприятия - благополучия и новых открытий.»
Парк приборов и оборудования регулярно обновлялся. В наше время гидрометеорологическая станция оснащена автоматизированными средствами наблюдений, сбора и обработки данных, и спутниковыми системами их передачи. В результате реализации Проекта по модернизации наблюдательной сети Росгидромета в 2012 году на станции Амдерма установлен автоматизированный метеорологический комплекс, а в 2021 году был модернизирован. Дополнительно установлены датчики осадков, метеорологической дальности видимости, продолжительности солнечного сияния, суммарной солнечной радиации и высоты облаков. На станции используется автоматизированное рабочее место метеоролога-наблюдателя, установлены программные средства для обработки материалов метеорологических наблюдений.
МГ-2 Амдерма включена в список реперных климатических станций Росгидромета. На станции регулярно обеспечивается качественное производство метеорологических, актинометрических, морских прибрежных гидрометеорологических и агрометеорологических наблюдений, наблюдений за загрязнением окружающей среды, и информационной работы. Материалы наблюдений МГ-2 Амдерма обобщены и опубликованы в климатических справочниках, ежегодниках и ежемесячниках. Оперативная информация станции используется синоптиками в прогностических целях, при обслуживании Ненецкого автономного округа и отраслей экономики страны.